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Data download聚合酶鏈式反應(PCR)作為分子生物學的基礎技術之一,已經(jīng)從基礎擴增發(fā)展出更高級的實時熒光定量PCR(qPCR)。而賽默飛(Thermo Fisher Scientific)作為PCR技術的設備制造商,其旗下的**熱循環(huán)儀系列(如ProFlex、SimpliAmp)與實時熒光PCR系統(tǒng)(如QuantStudio系列)**在全球范圍內(nèi)廣泛應用。
雖然它們都以“PCR"為核心,但在功能定位、檢測方式、硬件配置和應用目的上存在顯著區(qū)別。本文將圍繞這兩類儀器的不同,從技術角度展開解析,并為實驗選型提供參考建議。
熱循環(huán)儀,也被稱為“PCR儀",是用于擴增DNA模板的設備。其工作原理是通過反復加熱與降溫,實現(xiàn)DNA模板的變性、退火和延伸,最終形成成千上萬倍的DNA片段。
主要功能:精確控制溫度循環(huán),使PCR反應體系進行擴增。
檢測方式:不帶檢測功能,需擴增完成后使用凝膠電泳等方法進行檢測。
實時熒光PCR儀在傳統(tǒng)PCR的基礎上集成了熒光檢測模塊,可在每個循環(huán)結束后通過檢測熒光信號強度,實時監(jiān)測產(chǎn)物的擴增情況,實現(xiàn)定量分析。
主要功能:擴增+定量+分析,可得出Ct值、擴增曲線等數(shù)據(jù)。
檢測方式:通過熒光染料或探針檢測擴增產(chǎn)物的數(shù)量。
部件 | 熱循環(huán)儀(如ProFlex) | 實時熒光PCR儀(如QuantStudio) |
---|---|---|
控溫模塊 | 有(加熱/冷卻模塊) | 有(精密控溫) |
熒光檢測系統(tǒng) | 無 | 有(激發(fā)光源+檢測器) |
軟件系統(tǒng) | 控溫程序管理 | 控溫+熒光監(jiān)控+數(shù)據(jù)分析 |
數(shù)據(jù)輸出 | 溫度程序/運行日志 | 實時擴增曲線/Ct值/標準曲線 |
屏幕操作 | 彩色觸屏為主 | 彩色觸屏 + 軟件界面 |
基因擴增
載體構建(如限制性酶切連接)
突變引入
RT-PCR第一步逆轉錄
梯度PCR優(yōu)化反應體系
基因表達定量分析(qPCR)
微生物/病原體定量檢測
SNP 分型
DNA甲基化研究
藥物敏感性篩查
臨床分子診斷研究(如病毒核酸檢測)
簡而言之:熱循環(huán)儀偏向“擴增",而實時熒光PCR偏向“定量分析"。
模塊可更換(3×32、96孔、384孔)
支持梯度PCR
無熒光檢測系統(tǒng)
彩色觸控屏幕,操作簡潔
程序可存儲與USB導出
適合日常分子克隆、常規(guī)DNA擴增、PCR條件優(yōu)化等。
QuantStudio 3/5:適合科研初級用戶,96孔設計
QuantStudio 6/7 Flex:中高通量,支持96/384孔模塊轉換
QuantStudio 12K Flex:超高通量,支持OpenArray平臺
多通道熒光檢測(FAM、VIC、ROX等)
可實時生成擴增曲線、溶解曲線
支持標準曲線法、ΔΔCt法進行定量分析
軟件分析功能豐富,可輸出報告、熱圖、分型圖等
適合基因表達分析、臨床研究、病原檢測和基因分型等高要求實驗。
著重程序編排與管理
僅提供控溫和運行日志
無數(shù)據(jù)分析模塊
包含實驗設計、數(shù)據(jù)采集、擴增曲線分析等功能
可設置標準品濃度生成標準曲線
支持樣本定量、分型判定、熔解曲線分析等
實時熒光PCR的軟件功能更全面,處理的數(shù)據(jù)量也更大,需要一定的培訓基礎。
實驗目的 | 適用儀器 |
---|---|
克隆驗證、基因擴增 | 熱循環(huán)儀 |
熒光探針法病毒檢測(如SARS-CoV-2) | 實時熒光PCR |
梯度溫度優(yōu)化 | 熱循環(huán)儀(帶梯度功能) |
微量樣本絕對定量 | 實時熒光PCR |
教學與培訓用基礎PCR | 熱循環(huán)儀(如SimpliAmp) |
實驗室類型 | 推薦設備 |
---|---|
分子生物學基礎實驗室 | 熱循環(huán)儀(SimpliAmp、ProFlex) |
藥物研發(fā)、轉錄組分析實驗室 | 實時熒光PCR(QuantStudio 5/7) |
臨床或檢測中心 | 實時熒光PCR(QuantStudio 6/12K) |
教學、教學科研結合平臺 | 熱循環(huán)儀 + 熒光PCR組合配置 |
實時熒光PCR儀不是“版"熱循環(huán)儀,它們工作目標不同,一個側重擴增,一個側重實時檢測和數(shù)據(jù)分析。
熱循環(huán)儀無法進行定量分析,需后續(xù)用電泳或其他分析手段才能判斷擴增效果。
實時熒光PCR設備雖然價格較高,但在病毒檢測、基因表達分析等場景中不可替代。
賽默飛熱循環(huán)儀和實時熒光PCR儀是分子實驗室中各司其職的工具。前者是PCR技術的基礎設備,后者則是在其基礎上擴展出的數(shù)據(jù)分析平臺。選擇哪一種設備,應基于實驗目的、預算、操作人員的技能水平等綜合考慮。
對于基礎DNA擴增實驗,熱循環(huán)儀即可滿足;而涉及基因定量、分型分析等高級實驗,則必須依賴實時熒光PCR系統(tǒng)完成。